Oficina del Subsecretario
El Subsecretario es nombrado por el Secretario conforme a la Ley Orgánica y su función principal es sustituirle en caso de ausencia o interinato. El Subsecretario representa al Jefe de la Agencia en todo tipo de funciones oficiales y ejecuta todas las funciones que éste le delegue.
Actualmente, el Subsecretario tiene delegada formalmente la firma de permisos y endosos. Además, suscribe las resoluciones de índole cuasi-judicial y es jefe de ayudantes especiales.
Entre otras delegaciones actuales, se encuentra la representación permanente del Secretario en el "task force" de la Oficina del Gobernador para agilizar los proyectos de Ciudad Mayor, así como el grupo de trabajo interagencial de Mayagüez 2010.